20.03.2023 10:37
Новости.
Просмотров всего: 3854; сегодня: 5.

Ученые АлтГУ участвовали в расшифровке 3D структуры химозина марала

Ученые АлтГУ участвовали в расшифровке 3D структуры химозина марала

Ученые Алтайского государственного университета совместно с коллегами из Новосибирска, Кольцово, Уфы и Москвы расшифровали трехмерную структуру рекомбинантного химозина алтайского марала.

Рекомбинантный химозин марала — это фермент, полностью аналогичный тем, что выделяется слизистой оболочкой желудка оленят в период молочного вскармливания. Он способен заменить импортные препараты рекомбинантных молокосвертывающих ферментов, широко используемых в сыроделии.

От АлтГУ в проекте участвовали ученые ИЦ «Промбиотех», Российско-американского противоракового центра, института биологии и биотехнологии. Совместно с физиками, математиками, биоинформатиками, биологами, биотехнологами из других научных организаций им удалось пополнить банк PDB (Protein Data Bank), они депонировали пространственную структуру рекомбинантного химозина алтайского марала в PDB (Protein Data Bank) — это международный банк данных трехмерных структур белков. К 2023 году в PDB было представлено только две структуры химозинов — коровы и верблюда. Наши ученые оказались третьими.

«В мире существует два крупных научных хранилища, где хранятся данные о нуклеотидных последовательностях — это GenBank, для белков это PDB. Если в GenBank есть миллионы записей о разных генах, геномах и пр., то в PDB информации намного меньше, потому что расшифровать структуру белка — это на два порядка более сложная задача. На первом этапе мы должны узнать аминокислотную последовательность белка, потом этот белок получить, очистить, выделить так, чтобы получить препаративное количество этого белка, чтобы получить кристалл и потом уже понять его трехмерную структуру», рассказал ведущий научный сотрудник РАПЦ, кандидат биологических наук, доцент Дмитрий Щербаков.

Ученые Алтайского госуниверситета занимаются рекомбинантными ферментами уже несколько лет.

«С самого начал этой работы мы предполагали, что рано или поздно получим трехмерную структуру для химозинов тех млекопитающих, которые мы исследуем. Первым в этом ряду оказался химозин алтайского марала. Нам удалось не просто получить этот белок в нужных количествах, чтобы сделать выработку сыра. Мы смогли получить чистый белок и вырастить кристалл. Эта работа проводилась совместно с физиками из новосибирского академгородка. На основе кристалла удалось получить дифракционную картину — это когда на кристалл воздействуют определенным излучением и смотрят, как эти лучи рассеиваются при прохождении кристалла. Полученную дифракционную картину нужно было расшифровать — эту работу выполняли также коллеги из академгородка и Московского физико-технического института. Фактически из цифр (данных о рассеивании) и удалось воспроизвести трехмерную структуру», — отметил Дмитрий Щербаков.

С помощью трехмерной модели ученые рассчитывают приблизиться к пониманию тонких механизмов работы фермента. Например, узнать, почему он более термостабилен, чем его аналог. Зная трехмерную структуру, можно предполагать, как изменить фермент, чтобы улучшить его свойства.

«Это была комплексная работа, от Алтайского госуниверситета в проекте участвовала большая команды — это ученые из „Промбиотеха“, преподаватель кафедры экологии, биохимии и биотехнологии ИББ Дина Владимировна Балабова. Важна роль идейного вдохновителя исследования трехмерной структуры феремнтов, зав.кафедрой физико-химической биологии и биотехнологии, академик РАН, доктор химических наук, профессор Ольга Иванонва Лаврик. Полученный нами результат не является конечным. Мы будем получать и другие химозины — на очереди химозин тупаи, архара, косули и др. И, конечно, будем стремиться получить их трехмерные структуры», — подытожил Дмитрий Щербаков.


Ньюсмейкер: Алтайский государственный университет — 3390 публикаций
Сайт: asu.ru
Поделиться:

Интересно:

Как законно снизить налоговую нагрузку
28.03.2024 17:56 Консультации
Как законно снизить налоговую нагрузку
Предприниматели имеют право и законную возможность уменьшать налоги. Одна из самых очевидных мер – подбор оптимального налогового режима. Так, многим предпринимателям доступна упрощенная система налогообложения (УСН) с простой и понятной формой отчетности, ставкой до 6 или 15% в зависимости от...
О своих мечтах об отдыхе поделились российские дети
28.03.2024 12:18 Аналитика
О своих мечтах об отдыхе поделились российские дети
В преддверии II Всероссийского конкурса юного художника «Место в России, где я мечтаю побывать», который стартует 1 апреля 2024 года, эксперты Национального туроператора Алеан рассказали, куда хотели поехать дети, исходя из анализа работ прошлого года. Дети в возрасте от 6 до 15 лет поделились...
562 года назад на престол взошёл Иван III
28.03.2024 10:44 Новости
562 года назад на престол взошёл Иван III
В историю он вошел в первую очередь как собиратель русских земель и, по сути, создатель единого государства Российского, созидатель и мудрый дипломат – при Иване III не только расширяются границы, но и создается прообраз системы управления страной – пишутся единые законы, утверждается...
Ранее неизвестные петроглифы описали российские ученые
27.03.2024 18:03 Новости
Ранее неизвестные петроглифы описали российские ученые
Группа ученых из Кемеровского государственного университета во главе с доктором исторических наук Ольгой Советовой описала ранее неизвестные петроглифы, обнаруженные в ходе экспедиций последних трех лет. Среди найденных рисунков неожиданно оказалось и крайне редкое изображение парохода. Основной...
Неизвестный объект археологического наследия найден в Подмосковье
27.03.2024 17:20 Новости
Неизвестный объект археологического наследия найден в Подмосковье
В подмосковном городе Ликино-Дулево Орехово-Зуевского городского поселения археологи провели превентивное обследование территории, прилегающей к скверу Дулевского фарфорового завода. В результате был обнаружен ранее неизвестный исторический слой, который уже признан вновь выявленным объектом...